Teoría 1. Durante el desarrollo del esmalte el ameloblasto secreta las proteínas que sirven de soporte para el depósito organizado de los cristales de hidroxiapatita (Amelogenina, Ameloblastina y Enamelina). Al parecer el Fluoruro disminuye la síntesis y secreción de estas proteínas.
Teoría 2. Luego de la correcta disposición de los cristales, el ameloblasto secreta unas enzimas proteolíticas (Metaloproteinasa-20 y Calicreina-4) capaces de degradar las proteínas que quedaron luego de la organización de los prismas. Posiblemente el Fluoruro disminuye la síntesis y secreción de estas enzimas o produce su inhibición.